Path: Top > Penelitian_Dosen > Dosen > 2015

Analisis Kekerabatan Salmonella typhi Asal Jateng dan Yogyakarta Berdasarkan Sekuens Gen Flagellin fliC

Undergraduate Theses from JTPTUNIMUS / 2017-02-13 07:43:17
By : Sri Darmawati, Muhammad Evy Prastiyanto, Universitas Muhammadiyah Semarang (ciciekdarma@yahoo.com)
Created : 2015-12-17, with 1 files

Keyword : Analisis kekerabatan, Salmonella typhi, flagellin, gen fliC
Url : http://digilib.unimus.ac.id

Tujuan penelitian untuk analisis kekerabatan Salmonella typhi asal Jawa Tengah dan Yogyakarta berdasarkan sekuens gen flagellin fliC dan mengetahui jenis serovarnya serta mengetahui keanekaragaman genetiknya. Sampel penelitian adalah 10 strain bakteri Salmonella typhi (7 strain dari Semarang, 1 strain dari Salatiga dan 2 strain dari Yogyakarta) yang diisolasi dari kultur darah pasien Widal positif. Analisis sekuens gen fliC dilakukan dengan isolasi DNA, PCR, kemudian sekuensing. Analisis kekerabatan dilakukan dengan merekonnstruksi pohon filogeni berdasarkan Algoritme Neighbour Joining (NJ), dan analisis similaritas nukleotida digunakan program Phydit. Hasil PCR dan sekuensing menunjukkan ukuran gen fliC pada Salmonella typhi SLT.1 asal Salatiga adalah 1267bp sedangkan 9 strain yang lainnya berukuran 1452-1488bp. Analisis kekerabatan berdasarkan Algoritme NJ, topologi pohon filogeni terdiri dari 6 clade, berturut-turut clade 1 dan 2 beranggotakan masing-masing 3 strain, clade 3, 4, 5 dan 6 masingmasing beranggotakan 1 strain. Strain SLT.1 berkerabat dekat dengan BA 07.4(nilai similaritas 98,83%) dan EM.3 (nilai similaritas 98,74%) isolat Semarang yang terletak pada clade 1.

Copyrights : Copyright � 2001 by UNIMUS Digital Library
Universitas Muhammadiyah Semarang. Verbatim copying and distribution of this entire article is permitted by author in any medium, provided this notice is preserved.

Give Comment ?#(1) | Bookmark

PropertyValue
Publisher IDJTPTUNIMUS
OrganizationUniversitas Muhammadiyah Semarang
Contact NameDevi Pangastuti
AddressJl.Kedung Mundu 18
CitySemarang
RegionJawa Tengah
Countryindonesia
Phone+62-24-76740296
Fax024-76740291
Administrator E-mailtik@unimus.ac.id
CKO E-mailinfopus@unimus.ac.id

Print ...

Contributor...

  • , Editor: perpustakaan unimus

Downnload...